Baltra (South Seymour) to bardzo mała wyspa, jednak nie mniej ważna od wcześniejszych. Bowiem to właśnie na niej znajduje się główne lotnisko archipelagu. Zbudowane zostało one podczas II wojny światowej przez Marynarkę Wojenną Stanów Zjednoczonych, by patrolować Kanał Panamski. Żyjące tu legwany lądowe wprowadzono ponownie po tym, jak rodzima populacja wygasła podczas pobytu wojsk amerykańskich. Na wyspie można też spotkać legwany morskie i żółwie morskie.